三代试管流产可能由于多种因素导致，包括胚胎质量、子宫内膜厚度、激素水平等。尽管技术不断进步，但流产仍然是一个常见问题。

胚胎质量

在三代试管过程中，选取的胚胎可能存在某种基因缺陷或其他问题，这可能导致流产。有时候即使是看似健康的胚胎也可能发生异常，这是无法完全避免的风险。

子宫内膜厚度

子宫内膜对着床和妊娠起着至关重要的作用。如果子宫内膜过薄或者不适合着床，就会增加流产的风险。医生通常会监测子宫内膜的情况，并在必要时进行调整。

激素水平

激素水平的不稳定也是导致三代试管流产的原因之一。体外授精过程中使用的激素会影响女性身体的内分泌系统，如果激素水平不稳定或者出现异常，就会增加流产风险。因此在治疗过程中需要严格监测激素水平并及时调整。